GWAS, PRS, risk statification

유전자, 환경, 생활 패턴 등이 복합적으로 작용하여 발병되는 질환을 coplexcity가 높은 질환이라고 말합니다. 예를들어 파킨슨 병, 당뇨병, 암 등이 있습니다. 그리고 이 경우, 하나의 유전자 변이(SNP 등)가 질병을 야기하기보다는 각 하나만 있을땐 영향을 끼치지 않았던 SNP가 여러개가 모여서 결국은 질병을 야기하게 됩니다. 즉 다유전적 특성을 갖고 있습니다. 

 

*polygenic trait  : 다유전적 특성은 키나 피부색과 같이 두 개 이상의 유전자에 의해 영향을 받는 특성입니다. 여러 유전자가 관련되어 있기 때문에 다유전자 특성은 멘델 유전의 패턴을 따르지 않습니다. 많은 polygenic 형질은 또한 환경에 의해 영향을 받으며 multifactorial이라고 합니다.(https://www.genome.gov/genetics-glossary/Polygenic-Trait)

 

GWAS 는 특정 phenotype과 연관된  SNP를 조사합니다.  다유전적 특성을 연구하는데에 있어서 GWAS study 만으로는 SNP들 간의 연관성을 해석하기어렵습니다. 또한 단일 SNP에 대하여 선형적인 관계성을 평가한다는 한계점이 존재합니다. 그렇기 때문에 새로운 method가 필요했습니다.

 

그 중하나가 Polygenic Risk Score 방법입니다. 다양한 SNP들을 조합을 통해 그 효과와 영향을 예측하기 위한 방법이며,  rsik statification의 기준이 됩니다. PRS는 GWAS로부터 얻은 effect size를 wieght로 사용한 weighted sum 입니다.