1.
The Dynamics of the Human Infant Gut Microbiome in Development and in Progression toward Type 1 Diabetes
- 태아 및 유아의 장내 미생물 군집 조사
- 유전적으로 T1D에 걸리기 쉬운 33명의 유아 집단을 조사
- 주어진 종의 균주 조성은 개인마다 매우 다양하며, 개인의 조정은 안정적이다.
- Microbial metabolites 구성 및 경로의 diversity 또한 일정하게 유지된다.
- 16S rDNA V4, Illumina MiSeq V6, paired-end, QIIme
- 33명의 영아(이 중 11명 혈청전 환자), 로 부터 777개 샘플 (인당 최소 8 ~ 34)
- "유아의 장의 다양성은 처음에는 낮고 발달 중에 증가하여 2-3년 안에 안정화 됩니다." 증거
- shannon index 약 10.1 안팍을 유지하는 것을 확인할 수 있었다.
1.1.
- 인간 장내 미생물 군의 초기 군집화는 자궁에서 시작되며
- 자궁 내 환경이 무균 상태일 것이라는 일반적인 생각과 달리, 임산부의 태반에는 미생물 군집이 있는 것을 확인
- 건강한 임산부의 태반은 일관된 미생물 군집이 존재함을 확인
- 태반의 미생물군집과 구강의 미생물군유전체간의 유사도가 높은 것을 확인
- 유아의 장의 다양성은 처음에는 낮고 발달 중에 증가하여 2-3년 안에 안정화 됩니다.
1.2.
- 급성 영양실조(SAM)를 가진 어린이가 그러한 코호트를 사용하여 감소된 "미생물군 성숙도"를 나타내는 것으로 나타났습니다
- 출생 후 처음 2년 동안 조립되는 장내 미생물총
1.3
Human Microbiome Project( Reference Turnbaugh, Ley and Hamady7 , 57 , Reference Proctor58 )
and the MetaHIT project( Reference Ehrlich and Nelson2
2. Population-based metagenomics analysis reveals markers for gut microbiome composition and diversity
- 네덜란드 인구 1,135명 참가자의 미생물군집
- 내인성 요인 31개
- 외인성 요인 126개 : 12개 질병, 19개 약물 그룹, 4개 흡연 및 60개 식이 요인
- meta genome shotgun(MGS), 16S rRNA amplicon sequencign과 반대로 모든 DNA를 분석한 방법
- shannon index 약 1.5 ~ 3.5로 낮은 값에서 다양하게 분포하는 것을 확인
3. Reduced microbiome alpha diversity in young patients with ADHD
- 청소년, 14명 남성 ADHD, 17명 남성 대조군
- 16S rDNA seq, V1 and V2 Illumina MiSeq
- ADHD 환자는 Bacteroidaceae 및 Neisseriaceae 및 Neisseria spec 모두 높은 수준을 보였습니다.
청소년 ADHD에 대한 가능한 바이오마커로 발견되었습니다.
- shannon index 평균 5.5~6.0 임을 확인
